广州医科大学附属第二医院（番禺院区）健康管理中心开展一站式体检服务，承接团体和个人健康体检业务。位于门诊楼四楼。中心拥有一支由中高级职称的资深专家和医护人员＼服务人员组成的服务团队，配备有先进的体检设备（MR、CT、数字化医用X射线摄影系统、彩色超声诊断仪、心电图诊断仪等），并运用体检信息系统进行体检信息管理（将系统地打印单位人事部门存档需要的全体员工体检综述报告和团检综合分析报告，并可以提供电子版存档备查）。体检完成后，除提供体检报告和资深医师的专业解答外，有需要时中心可提供绿色就医通道服务。