南京市第二医院(江苏省传染病医院，南京市公共卫生医疗中心），又名南京中医药大学附属南京医院，东南大学附属第二医院，同时挂牌南京市肿瘤医院、南京市老年病医院。由宋美龄基金会创建于1933年，是集医疗、教学、科研、预防为一体，以“精专科、强综合、重防治、应突发”为特色的三级甲等医院。医院先后荣获卫生部“全国卫生系统抗击非典先进集体”、中组部“全国防治非典型肺炎工作先进基层党组织”、国家卫生计生委“人感染H7N9禽流感疫情防治工作中表现突出单位”、“国家埃博拉出血热疫情防控先进集体”等荣誉称号。

医院现分为钟阜院区、汤山院区、南山院区三个院区，开放床位1955张。现有在职职工1455人，其中卫技人员1294人，高级职称人员252人，博士36人，硕士339人。有感染性疾病科1个国家临床重点专科，感染性疾病学、传染科、肿瘤科、妇产科、普通外科、肝病科、结核科7个江苏省重点学科、专科，中西医结合科1个江苏省示范中医科，肠道及其他传染病科、检验科、医学影像科、重症医学科4个南京市重点专科，中心实验室1个南京市医学重点实验室，国家中医药管理局重点研究室1个。近五年获省、市级科研成果奖37项，承担国家自然科学基金13项、国家科技重大专项10项、省部级科研项目30项，获专利授权34项，编写专著41部，发表SCI及中华、中文核心论文300余篇。

钟阜院区地处鼓楼区钟阜路1-1号，占地面积42亩，总建筑面积8万平方米。综合学科齐全，开设外科、妇产科、肿瘤科、呼吸科、胸外科、骨科、神经外科、心血管内科、中医科、重症医学科等40多个临床、医技科室，发展综合救治水平以支撑传染病患者的救治、反哺传染病科室的发展，常规开展肝硬化、肝癌、肺结核、肺癌、骨关节结核、脑积液的外科和介入手术，为传染病患者诊疗提供强有力的综合保障，同时为城北地区百姓提供全面、优质的综合医疗服务，医疗服务辐射至安徽、山东等邻近省份。