武威医学科学院下属甘肃省武威肿瘤医院、武威消化病医院、武威肝病医院（武威肝胆中心）、武威心脏血管病专科医院、武威市体检中心、北院区（武威医科院神经内科、内分泌科）、甘肃重离子医院等分支机构。编制床位1000张，年门诊量20万人次，住院治疗2.6万人次。现为兰州大学、张掖医学高等专科学校、武威职业学院临床教学医院，也是兰州大学硕士研究生培养点。是我市获国家专利最多的医疗机构，形成了以消化系统疾病、心脏血管系统疾病、肿瘤疾病为三大诊疗特色的现代化智慧品牌医院。

以“136人才建设工程”为代表的人才兴院战略，培养了一大批优秀的学科带头人和技术骨干，现有职工1300余人，其中专业技术人员975人，中高级职称200余人，硕士以上学历人才63人。兰州大学硕士生导师2名，兼职教授6名。自2012年起，专业人员在德国、美国、日本等地轮训，为我市乃至甘肃国际化医疗注入新活力。

设备装配水平居省内先进水平，拥有动态500排宝石能谱CＴ、3.0T超导型核磁共振仪、派特CT、64排大孔径CT、双光子直线加速器、GE心血管造影系统、ECT、太空飞秒准分子、四维彩超、人工肝支持治疗系统等大型设备200余台。

近年来，医院多项医疗技术已达到国内先进水平，成为全国首家开展呼吸暂停放射治疗的医院和甘肃省内能够独立开展腹腔镜胰十二指肠切除术、腹腔镜胃癌根治术的两家医院之一。肿瘤内科可开展ERCP，内镜诊断下的各类食管癌、胃癌的微创手术，各种重症呼吸衰竭的诊治及肿瘤介入治疗等肿瘤内科疾病的诊治。外科可开展腔镜下胰十二指肠切除术、腔镜下胃癌根治术、腹壁无切口胃癌根治术、标准半肝切除术，管胃成形术等高难度手术。放疗科可开展各类癌症的适形放射治疗及三维适形调强放疗技术。开展了各类介入诊断和介入治疗、微创诊断、微创治疗，运用先进的内窥镜、腹腔镜、胸腔镜、纵隔镜等影像检查技术，开展经皮、肝、肺、肾、乳腺、甲状腺等各类肿块的穿刺、细胞学和各体体液的脱落细胞学检查，开展基因诊断、肿瘤标志物检查等项目。